「bacteriotrypsin」は接頭辞「bacterio-」（ギリシャ語 'bakterion' = 「小さな棒」から）と「trypsin」（ギリシャ語 'tryein' に由来する酵素名）を結合して作られている。

「bacteriotrypsin」は現代の生化学命名法で、既存の酵素名「trypsin」に結合形「bacterio-」を付けて作られ、『細菌由来のトリプシン様酵素』を意味する用語として成立した。

当初は『細菌由来のトリプシン様酵素』を指すために造られた用語であり、その後も生化学領域では同様の専門的意味で使われている。