「bacterio-」はギリシャ語「bakterion」（小さな棒、杆）に由来する結合形であり、「toxin」はギリシャ語「toxikon」（毒）に由来する名詞要素の結合によってできた語です。

「bacterio-」はニューラテン語・学術語彙（例：'bacterium'）に取り入れられ、「toxin」は近代科学ラテン語・ギリシャ語を経て英語に入った。これらの要素が近代の科学英語で結合して『bacteriotoxin』が作られました。

当初は要素それぞれが「桿状の微生物」と「毒」を意味していたが、結合語は次第に「細菌によって産生される毒素」という特定の意味に定着しました。