「bacteriocin」は新ラテン語／現代の学術造語に由来し、接頭辞 'bacterio-' はギリシャ語 'bakterion'（小さな棒〈桿〉）から、接尾辞 '-cin' は「毒素(toxin)」のような語形成要素（生物活性物質を示す）から来ている。

ギリシャ語の 'bakterion' がラテン語／新ラテン語の 'bacterium' となり、20世紀に科学者が細菌が産生する抗菌性タンパク質を指すために 'bacteriocin' を造語し、英語の学術語彙に定着した。

当初は細菌や細菌生成物を広く指す要素だったが、時間とともに『同種または近縁の細菌を抑制するタンパク質性の物質』という特定の意味に定着した。