「anatoxin」はギリシャ語の接頭辞「ana-」（上へ、再び、戻る）と「toxin」（毒）から派生した。

「anatoxin」は近代科学英語でギリシャ語由来の「ana-」と「toxin」を組み合わせて作られ、現代英語の「anatoxin」になった。

当初は一般的な毒素を指していたが、時間とともに特に細菌（特に藍藻類）が産生する神経毒素を指すようになった。