「ピリドキシン」は、基本的な複素環式有機化合物である「ピリジン」と化学命名法で使用される接尾辞「オキシン」から派生。

「ピリドキシン」は、20世紀初頭に「ピリジン」と「オキシン」の組み合わせから派生し、ビタミンB6のこの形態を表すようになった。

当初は特定の化学構造を指しており、ビタミンB6の形態としてこの意味を保持している。