「diastereoisomer」は近代の学術造語で、語源はギリシャ語と新ラテン語に遡る。接頭辞の「dia-」（ギリシャ語 'διά'）は「離れて／通して」を意味し、「stereoisomer」は「stereo-」（ギリシャ語 'stereos'）が「立体（固体）」を、「isomer」が「等しい部分」を意味する語から来ている。

「diastereoisomer」は立体化学の概念が確立された19世紀末〜20世紀初頭に、'dia-'と 'stereoisomer' を組み合わせて化学用語として成立し、'diastereomer' の変形とも近縁の語として現れた。

当初から鏡像ではない立体異性体を指す専門用語として造られ、現代でもその技術的な意味は維持されている。