「bacteriophobia」は現代の結合形から生じた語で、'bacterio-'はギリシャ語の「bakterion」（『小さな棒』または『桿』を意味）に由来し、'phobia'はギリシャ語の「phobos」（『恐怖』を意味）に由来します。

「bacteriophobia」は現代英語の合成語として発展しました。ギリシャ語の「bakterion」はニューラテン語で'bacterium'となり、結合形'bacterio-'が生じ、ギリシャ語の「phobos」はニューラテン語を経て英語の'phobia'となり、これらが結合して現代英語の「bacteriophobia」になりました。

語根は元々『桿状の生物』と『恐怖』を示しましたが、結合して現在では『細菌への恐怖』というより一般的な意味を持つようになりました。