「autovaccine」はギリシャ語由来の接頭辞「auto-」（ギリシャ語 'autos'、『自己』）と、最終的にラテン語の「vaccinus」（'vacca'、『牛』）に由来する「vaccine」を組み合わせてできた語である。

「vaccine」はラテン語「vaccinus」を経て英語に入り、18世紀後半にエドワード・ジェンナーが牛痘（'vaccinia'）に関する物質を指して広めた。『autovaccine』はその後の医学英語で『auto-』と『vaccine』を結合して作られた語である。

当初『vaccine』は牛に由来する物質（天然痘への対抗に用いられた）を指していたが、やがて免疫を与えるための任意の調製物を意味するように拡張され、現在『autovaccine』は患者自身の病原体から作られたワクチンを特に指すようになった。