「auto-」はギリシャ語で「自己」を意味し、「immune」はラテン語の「immunis」（免除された・保護された）に由来し、動詞化接尾辞「-ize」はギリシャ語の '-izein' を経て借用されたものが組み合わさってできている。

「immune」はラテン語 'immunis' から来てフランス語を経て英語に入った。「auto-」と「immune」「-ize」を組み合わせた語は20世紀の医学英語で、自己に向かう免疫反応を指す語として成立した。

構成要素は元々「自己」と「免除・保護」を別々に示していたが、医学用語として結びつくことで「自己に向かう免疫（自己免疫）を引き起こす／起こすこと」を意味するようになった。