「aspartokinase」は現代生化学で造られた語で、『aspartate』（アスパルテート＝アスパラギン酸）と『kinase』の結合から成る。'aspartate'は最終的にアスパラガス（ラテン語 'asparagus'）に由来するアスパルテ酸の名に由来し、'kinase'はギリシャ語の運動を意味する語根（'kinein'/'kinēsis'）に由来するが、生化学ではリン酸基を転移する酵素を示す接尾辞として使われる。

『aspartokinase』は20世紀の酵素命名法の中で『aspartate kinase』や『aspartate phosphokinase』といった表現から発展し、生化学文献で短縮形の『aspartokinase』の使用が定着した。

当初は『アスパラギン酸を基質とするキナーゼ』という意味であったが、その核心的意味は保持され、現在ではアスパルチルリン酸の生成という特定の反応を触媒する酵素を指す。