「aquaphobia」はラテン語の「aqua」とギリシャ語の「phobia」を結合してできた語で、ラテン語の「aqua」は「水」、ギリシャ語の「phóbos」（φóβος）は「恐れ」を意味します。

「-phobia」は19世紀以降の医学・心理学用語（新ラテン語を通じて英語に入った）で、様々な語根と結合して特定の恐怖症の名称を作るために用いられてきました。"aquaphobia"はその現代的な造語です。

もともとは要素として「水」と「恐れ」を意味していましたが、時代を経て「水または溺れることへの特定の（しばしば臨床的な）恐怖」を指す語になりました。