「antiprotozoal」は現代英語に由来し，接頭辞「anti-」（〜に対して）と「protozoal」（protozoa＝原虫に由来）から成る。

「protozoa」は新ラテン語の'Protozoa'に由来し，ギリシャ語の'prôtos'（最初）＋'zôon'（動物）から来ている。形容詞'protozoal'は'protozoa'から発展し，英語で接頭辞'anti-'を付けて'antiprotozoal'が作られた。

元は文字通り「原（最初の）動物（原虫）に対する」という意味だったが，次第に原虫寄生虫に対する薬剤や作用を指す語として使われるようになった。