「アミグダーゼ」はギリシャ語の「amygdalē」に由来し、「amygdal-」は「アーモンド」を意味しました。

「amygdalē」は現代英語の科学用語「amygdalase」に変化しました。

最初はアーモンドに関連する物質を指していましたが、時間とともにアミグダリンの加水分解に関連する酵素の現在の意味に進化しました。