「amphioxididae」はギリシャ語に由来し、特に「amphi」は「両方」、「oxys」は「鋭い」を意味し、動物の尖った端を指す。

ギリシャ語で「amphi」と「oxys」が組み合わさり「amphioxus」となり、後に科名「amphioxididae」として適応された。

最初は動物の鋭く尖った性質を指しており、この意味は現代でもほぼ同じままである。