「アレルゲン」はギリシャ語の「アレルギア」に由来し、「アロス」は「他の」、「エルゴン」は「働き」を意味しました。

「アレルギア」はドイツ語の「アレルゲン」に変わり、最終的に現代英語の「アレルゲン」になりました。

最初は「異物に対する反応」を意味していましたが、時間とともに「アレルギー反応を引き起こす物質」という現在の意味に進化しました。