「ペプトン」はギリシャ語の「ペプトス」に由来し、「ペプトス」は「調理された」または「消化された」を意味しました。

「ペプトス」はフランス語の「ペプトン」に変わり、最終的に現代英語の「ペプトン」になりました。

最初は「調理されたまたは消化された物質」を意味していましたが、時間の経過とともに「細菌学で使用されるタンパク質加水分解生成物」の現在の意味に進化しました。