「misalign」は「誤って」を意味する接頭辞「mis-」と「並べる」を意味する古フランス語「aligner」から来ています。

「aligner」は英語の「align」に変わり、接頭辞「mis-」が加わって「misalign」になりました。

最初は「誤って並べる」という意味で、現代でもその意味はほぼ同じです。