「isomer」はギリシャ語の「isomerēs」に由来し、「iso-」は「等しい」、「meros」は「部分」を意味しました。

「isomerēs」はフランス語の「isomère」に変化し、科学ラテン語を経て現代英語の「isomer」になりました。

最初は「等しい部分を持つ」という意味でしたが、時間とともに「同じ化学式を持つが異なる構造を持つ化合物」という現在の意味に進化しました。