「deactivate」は、ラテン語の「activare」から来た「activate」に「de-」という接頭辞を付けたものです。

「activate」はラテン語の「activare」から変化し、現代英語の「activate」になり、「de-」が付け加えられて「deactivate」になりました。

最初は「活性化を逆にする」という意味で、現代でもその意味はほぼ同じです。