『azotobacter』はニューラテン語に由来し，語は『Azotobacter』で，'azoto-'はフランス語の『azote』（ギリシャ語のa-「無」＋zōē「生命」由来）に由来し『窒素』を意味し，'bacter'はギリシャ語の'baktērion'『小さな棒（桿）』を意味する。

『azotobacter』は19世紀に『azoto-』（窒素に関する）と『bacter』（棒状の微生物）を結合して科学的ニューラテン語として造られ，その後窒素固定性の土壌細菌属の学名『Azotobacter』として現代英語に入った。

当初は文字通り『窒素（に関係する）棒（状のもの）』を示す語構成だったが，次第に窒素固定を行う土壌細菌の属名としての専門用語に変化した。