「antiatom」はギリシャ語由来の接頭辞「anti-」と名詞「atom」を結び付けた現代英語の語形成に由来します。接頭辞「anti-」は（ギリシャ語で）「反対／逆」を意味し、「atom」はギリシャ語の「atomos」（分割できない）に由来します。

「anti-」はラテン語・新ラテン語を経て英語の生産的な接頭辞として入ってきました。「atom」はギリシャ語 'atomos' → ラテン語 'atomus' → 中英語 'atom' を経て、20世紀の反物質概念の発展とともに「antiatom」という複合語が現代の科学用語として作られました。

当初、それぞれの構成要素は「反対／逆」と「分割できない」を表しましたが、時間とともに複合語は反物質の文脈で「反粒子で構成された原子」を指すようになりました。