「アナベナ」はギリシャ語の「anabainein」に由来し、「ana-」は「上へ」、「bainein」は「行く」を意味しました。

「anabainein」は科学的ラテン語の「anabaena」に変わり、最終的に現代英語の「anabaena」になりました。

最初は「上へ行く」を意味しましたが、時間とともにシアノバクテリアの属の現在の意味に進化しました。