「アメーババクテリエ科」は新ラテン語から由来し、「アメーバ」と「バクテリウム」の組み合わせで、「アメーバ」は単細胞生物の一種を指し、「バクテリウム」は微生物の一種を指します。

「アメーバ」と「バクテリウム」の組み合わせから新ラテン語で「アメーババクテリエ科」として派生しました。

最初はアメーバのような特徴を持つ細菌の科を指し、この意味は現代の分類学でも一貫しています。