「アメーババクター」はギリシャ語の「amoibe」（変化）と「bakterion」（小さな棒）に由来します。

「amoibe」と「bakterion」が組み合わさり、現代の科学用語「アメーババクター」となりました。

最初はアメーバ様の動きをする細菌を指していましたが、現在では紫色硫黄細菌の属を特に指します。