「アロエエモジン」は、「アロエ」という植物の属名と、特定の植物に含まれる化合物「エモジン」の組み合わせに由来する。

「アロエエモジン」は、アロエ植物とその化学成分の研究から派生し、この特定の化合物の同定に至った。

最初はアロエ植物の化学化合物として認識され、時間とともに下剤としての使用が顕著になった。