「アゴニアディン」は「アゴニア」樹の名前に由来し、「アゴニア」はその薬効のある樹皮で知られる樹種を指す。

「アゴニアディン」という用語は「アゴニア」樹の名前と、そこから抽出された物質を示す接尾辞「-din」から派生した。

当初はアゴニア樹から抽出された物質を特に指しており、この意味は現代でもほぼ同じままである。