「アクリフラビン」は「アクリジン」と「フラビン」から由来し、「アクリジン」は化学化合物、「フラビン」は黄色の染料を指す。

「アクリフラビン」は20世紀初頭に「アクリジン」と「フラビン」の組み合わせから派生した。

当初は主に消毒特性のために使用されており、この意味は現代でもほぼ同じである。