「アクリフラビン」は「アクリジン」と「フラビン」から由来し、「アクリジン」は化学化合物、「フラビン」は黄色の色素を指す。

「アクリフラビン」は20世紀初頭に「アクリジン」と「フラビン」の組み合わせから派生した。

当初は主に染料として使用されていたが、時間とともに消毒剤や防腐剤としての現在の用途に進化した。